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QTL定位

数量性状在遗传上是由很多基因控制的,其中每个基因对表现型具有相对小的效应,但很大程度上受环境因素影响。控制数量性状的主效基因位点通常记为QTL (Quantitative Trait Loci)。分子标记连锁图谱的大量出现,使得我们可以像研究质量性状基因一样研究数量性状基因,也可以把单个数量性状基因定位在染色体上,并估计其遗传效应,这一过程称为QTL作图或定位。

Sample requirements

材料准备            

首先需要构建作图群体进行高质量遗传连锁图的绘制,然后测定作图群体中不同个体或株系的标记基因型;对标记基因型数据进行连锁分析,构建标记连锁图。然后将QTL定位在遗传图谱上,确定QTL与遗传标记间的距离(以重组率表示)。

  •                            

    作图群体

    临时作图群体:F1、F2、BC等
    永久作图群体:RIL、NIL、DH等
  •                            

    分子标记

    SSR
    SNP
  •                            

    模型选择

    区间作图法 IM
    复合区间作图法 CIM
    多重区间作图法 MIM

Schematic diagram and flow chart

技术示意图及具体流程                

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Credit analysis

结果展示            

  • 定位结果 /                            
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    基于标记的分析法正是通过检验标记的不同基因型之间的这些差异来判断标记是否与QTL连锁的。