【全面高效定位】康普森小麦90K基因分型芯片

来源: 发表日期:2018-01-05 浏览量:494

 导读   

芯片探针数目84,662个,康普森小麦90K基因分型芯片是由北京市农林科学院北京杂交小麦工程技术研究中心联合康普森生物定制的一款高质量芯片。经过中国春、济麦22等品种验证,其涵盖了我国十大麦区大面积推广品种、骨干亲本、地方品种等。康普森小麦90K基因分型芯片集成了筛选后的所有高效定位位点。

 

 

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芯片设计技术路线
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芯片特点

1)有效性标记多:

质量高、稳定性高、重复性好:均根据评分值、信号强度、缺失率、重复性、是否符合遗传规律、拷贝数、多态性、杂合率、三类具有明显界限等原则,经过大部分育成品种筛选验证后入选;平均检出率高于97%

准确性高:所有标记均清晰可见,选择PHR类型位点

多态性高:MAF值大于0.2,能区分近等基因系

2)基因组信息完善:所有标记有定位信息,且部分标记功能清楚,主要与产量、抗病、品质等性状有关

3)完全自动化:基于GeneTitan™ Multi-Channel基因芯片分析系统平台,完全自动化读取数据,无需人工校正结果,避免人为误差,准确高效

4)分布较均匀:A基因组占38.0%,B基因组占39.6%,D基因组占22.4%

5)密度高:平均遗传距离小于0.1CM

6)性价比高,应用性强

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80个功能相关位点信息

1)产量性状相关基因:包括株高、千粒重、籽粒大小等

2)抗病性状相关基因:抗条绣、赤霉病等抗病基因位点

3)生长性状相关基因:春化、抗穗发芽、抗逆、品质、熟期、开花期等

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相关应用

科学研究:

  • 功能基因研究

  • 遗传图谱构建

  • 群体遗传学,群体进化

  • QTL、GWAS、BSA定位

育种应用:

  • 分子标记辅助选择育种

  • 种子纯度和真实性检测

  • 遗传育种值测定,基因组选择育种

  • 小麦DNA指纹图谱鉴定,种质资源遗传多样性分析

  • 品种知识产权保护


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