一招轻松完成SNP位点分类作图
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发表日期：2018-01-08
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一招轻松完成SNP位点分类作图
很多老师在拿到SNP的分型结果时，对于众多的AA，AB，BB字母标识的分型结果表示无所适从，尤其是有亲缘关系的样本数据结果，老师很希望直观看到不同子代样本的SNP分型纯合或杂合情况，便于直观的从中发掘到更多有意义的信息。所以，小编就教大家如何把单一的分型字母标识的结果稍作包装，转成辨识度较高的色彩展示结果的方法----用excel就可以轻松实现SNP位点分类作图。
开讲！
需要准备的文件：
1）SNP位点分型结果文件：比如AA，AB，BB形式的分型结果文件，此形式文件可以直接从Illumina公司的官方软件GenomeStudio中直接导出。
2）Excel软件
步骤展示：
1、首先将分型结果导入到excel(以2016版为示例)中，其中每一行为一个SNP位点，每一列为一个样本，结果如下:
2、选中数据，在开始菜单中找-条件格式
3、在条件格式中我们找到突出显示单元格规则-等于
4、为等于以下值得单元格设置格式
输入：AA(以AA为例)
颜色设置 自定义格式—单元格样式-颜色-浅红色填充深红色文本 -确定
5、此时我们会看到符合条件的分型AA都用浅红色来突出显示了。
依次类推，分别对AB，和BB，NC重复以上步骤，一张炫目的SNP位点分类图就这么轻松完成了。
请看最终版的成果展示：
当然条件格式里面还有数据条，色阶等功能可以使结果展示的更加直观与丰富多彩，这里就不一 一展示结果，如果感兴趣，就赶快行动起来，动手制作属于你自己SNP位点分类图吧。
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