大家好,给大家介绍一下,这是我公司的“新”片@凤芯壹号

来源:康普森 发表日期:2017-12-21 浏览量:246

一转眼漫长又短暂的国庆八天长假就过去了,这个假期玩的怎么样?遇到了什么样跟生物有关好玩的人或事?不妨在公众号中跟我们分享分享。

这两天的微博和朋友圈都被鹿晗公布恋情的微博刷屏了,众多厂商们也纷纷来“蹭热点”,小编也正好借此机会来给大家介绍一下我们康普森的小鲜肉@凤芯壹号
先做个自我介绍
凤芯壹号是由中国农业大学和北京康普森生物技术有限公司联合研制开发的,是国内首款针对中国蛋鸡品种的基因分型芯片。该芯片在位点设计上,以我国选育多年的高产蛋鸡纯系和特有的地方蛋鸡品种为主,整合了已有GWAS和QTL的研究成果, 重点关注产蛋、抗病、饲料利用率、蛋品质等经济性状。对于国产蛋鸡品种而言具有更好的适用性和更高的性价比。

芯片的位点来源

基于国内自主选育蛋鸡重测序数据优选:~19K
通过对7个蛋鸡品种共479只鸡的基因组重测序结果进行分析,找出品种间共有和特有的SNP位点, 通过特定比例组合筛选,以保证芯片可以用于各蛋鸡品种的分子育种和种质资源鉴定等工作。
基于已有的经济性状相关位点研究成果:~20K
1.利用Illumina Chicken 60K SNP Beadchip对白来航蛋鸡40个家系600只母鸡,矮小型褐壳蛋鸡40个家系600只母鸡进行蛋壳强度、颜色、厚度、高度等进行了GWAS研究;
2.利用Affymetrix Chicken 600K SNP Array对以白来航和东乡绿壳蛋鸡为亲本组建成一个正反交群体的F2代1,512个母鸡进行产蛋、蛋品质、繁殖性能、饲料利用率等经济性状的GWAS研究;
3.利用重测序技术对美国USDA抗病近交系(63vs72)群体进行抗病性状研究;
4.结合已有研究成果和QTL数据库,筛选出适合中国蛋鸡育种的有效位点;从Affymetrix Chicken 600K SNP Array中优选:~11K


位点信息

优化设计:所有位点在全基因组上分布均匀且有相近的LD水平;
功能相关性:基于中国农业大学畜禽育种国家工程实验室杨宁教授课题组的前期研究成果和现有QTL数据库,重点与产蛋性能、抗病性状、饲料利用效率和蛋品质等性状相关;
适用性:芯片位点来源于在我国选育多年的高产蛋鸡品种以及我国特有地方品种的重测序结果,更加适用与中国蛋鸡企业进行分子育种工作;
通量适中:在蛋鸡全基因组选择育种实践中应用性价比高基因


不同染色体片段LD水平                            全基因组分布图

探针在各个染色体上占有比例趋势图

看了这篇文章之后,如果您对我们的“凤芯壹号”还有什么疑问的话,随时欢迎您联系我们,我们的技术人员将会给您更详细的讲解和介绍。

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