猪不可貌相!基因可衡量!“中芯一号”,打造优质种猪!

来源: 发表日期:2018-07-09 浏览量:256

  种业是国家战略性、基础性的核心产业。目前,我国的猪育种普遍采用进口基因芯片,这对“华系种猪”的推动非常有限。随着我国猪全基因组测序研究的不断深入和芯片技术的不断发展,打造民族品牌的猪育种芯片已经成为可能,“中芯一号”应时而生。

  “中芯一号”是什么

  “中芯一号”是国内首款infinium XT-96格式猪育种SNP芯片。

  “中芯一号”以江西农业大学黄路生院士团队研究成果为基础,集成了国内10所高等学校及科研院所在猪基因组研究领域的研究成果,自主设计,利用illumina平台定制完成的基于基因组全序列芯片。

  北京康普森生物技术有限公司为“中芯一号”唯一授权备货公司。

  “中芯一号”全面、精准、先进、实用、时效性强,是“华系种猪”实现良种国产化的利器,是中国猪育种行业真正崛起的力量,是分子技术服务产业、惠及民生的重要途径。

  “中芯一号”有哪些特性

  一、全面性:

  评估性状全面:涵盖猪从出生到屠宰整个生育期的繁殖、生长肥育、胴体、肉质、免疫等七大类、422个性状。

  评估群体全面:以杜长大、F2资源家系、两头乌、苏太、嵌合家系、莱芜、二花脸、巴马香、疝气等9个群体作为参考群。

  单倍型库全面:目前已有涵盖杜、长、大主要商品品种及中国六大类型地方品种高覆盖度的基因组全序列单倍型库。

  二、先进性:

  按功能区分标记类型:因果突变、紧密关联、一般关联、基因组分布位点。

  包含控制重组率基因:可通过重组增大表型变异,增进遗传进展。

  等位基因效应已知:部分功能检测不需要构建参考群,新测表型可纳入现有参考群中更新效应。

  芯片可升级:可依据增测的表型数据和填充后的基因组全序列,不断增加因果位点和紧密关联位点数目,升级芯片。

  重组冷热点:考虑重组冷热点,设计芯片分布密度。

  实验流程有何特点

  “中芯一号”可进行大量样本高效基因分型,每个样本可以检测多达51,368个位点,能够实现100,000到1,000,000样本/年的大规模检测。简化了定制实验分析设计流程,样本周转时间缩短33%,由3天降至2天。

  “中芯一号”工作流程改进图


  实验时间为两天:第一天,进行DNA扩增、酶促片段化、沉淀和重悬。随后样本过夜孵育的过程中与BeadChip杂交,DNA经退火得到位点特异性的50-mer探针,与某种Infinium微珠类型共价偶联。

  第二天,Infinium XT工作流程继续酶基延伸赋予等位基因特异性,然后进行荧光染色。IScan仪检测微珠的荧光强度,Illumina软件自动执行分析和基因型识别。

  “中芯一号”可扩展哪些应用

  “中芯一号”可以进行少量位点的分析,尤其适用于品系,肉质追踪,以及基因组选择的应用。

  “中芯一号”是GWAS研究的利器。可对多个个体在全基因组范围的遗传变异多态性进行检测,获得基因型,进而将基因型与可观测的性状,即表型,进行群体水平的统计学分析,根据统计量或P值筛选出最有可能影响该性状的遗传变异。

  “中芯一号”也是GS研究的利器。通过检测覆盖猪全基因组的分子标记,利用基因组水平的遗传信息对个体猪进行遗传评估,可以获得更高的育种值估计准确性。对早期难以度量的性状进行选择,缩短世代间隔,加速育种进程,从而节约大量的育种成本。估算个体基因组育种值,对育种场选育群体进行打分排名,实现早期精准选育。

  “中芯一号”还可用于猪基因组其它方面的研究应用,不仅可获得出色的数据质量和检出率,还具有高度重现性,为用户提供一如既往高品质的技术服务。


  “中芯一号”现已上市,

适合“杜长大”等猪种的检测,

也是助力“华系种猪”走向世界的利器,

欢迎订购!


  康普森生物愿景:


  中国自主育种之路必将大繁荣大发展,各行业一起打造“华系种猪”,让民族品牌面向全国,走向世界。


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