大豆200K功能性SNP分型芯片,助力大豆科研创新!

来源: 发表日期:2018-07-17 浏览量:95

  中国是大豆的故乡,大豆,在古代称为“菽”。《五帝本纪》中写道:“炎帝欲侵陵诸侯,诸侯咸归轩辕。轩辕乃修德振兵,治五气,鞠五种,抚万民,庆四方。”郑玄曰:“五种,黍稷菽麦稻也。”司马迁在《史记·卷二十七》中写道:“铺至下铺,为菽。”由此可见我国种植大豆历史悠久。


  大豆是人类、动物获取油脂和蛋白质的主要来源,分栽培种和野生种。栽培种是由野生种经过人工栽培、选择演变而来的。现代栽培的大豆大约在5000年前由其近亲野生大豆驯化,继而进一步选育而成。随着测序技术的发展,对大豆基因组进行测序研究,为大豆种质资源的保护、开发、利用和拓宽大豆育成品种遗传基础、推进大豆新品种培育进程提供了信息资源。


  康普森大豆200K功能性SNP分型芯片,由中国农业科学院作物科学研究所与北京康普森生物技术有限公司合作研发,通过Thermo Fisher平台定制完成,是一款中高通量的SNP分型检测芯片。

  位点数/样本:~200,000

  芯片规格:96 样本/芯片

  SNP位点设计特点

  代表性高:信息来自目前国际上千余份最大规模代表性大豆重测序和第一个植物泛基因组——野生大豆泛基因组数据。

  设计优化:40%的SNP均匀覆盖全基因组,代表LD block。

  功能性强:60%的SNP为注释基因的Large-effect位点,包括驯化和遗传改良选择区间以及野生和栽培大豆种间特有及种内亚群间特有的SNP位点。

  性状突出:突出了开花、脂肪和脂肪酸、异黄酮、蛋白质、株高、百粒重、转录因子、抗病基因、水杨酸、茉莉酸等重要性状或代谢途径。

  实用性好:基本涵盖了已公布的重要性状相关标记。

  通量适中:便于分子遗传学家和育种家利用。

  鉴定高效:分辨率高,特异性好。

  位点信息


  芯片应用

  01资源保存与育种

  种质资源本底扫描

  亲缘关系鉴定

  分子标记辅助聚合育种

  全基因组选择

  02基础研究

  全基因组关联分析

  遗传图谱构建

  基因定位和克隆

  遗传多样性分析

  分子进化分析


  大豆200K功能性SNP分型芯片,可广泛用于遗传多样性分析、全基因组关联分析、QTL精细定位、分子进化分析、分子标记辅助育种、全基因组选择等,在聚合育种及拓宽品种的遗传基础方面将发挥重大作用。正在进行大豆基因组方向研究的亲,赶快联系我们吧,联系电话:400 186 9509。


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