玉米6K基因分型芯片
康普森玉米6K基因分型芯片是是一款中等密度育种芯片，由康普森生物和中国农业科院作物科学研究所联合开发，通过Illumina 和 Thermo Fisher 平台定制完成的一款玉米育种芯片产品，既可以研究温带材料又有效于热带材料的分子育种研究。
位点信息：5,179个位点，24制式/384制式
Array Characteristics
芯片特点
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适用性广
温带和热带材料分布无显著差异的SNP 标记占比高达2/3 -
覆盖度高
含2,200 多个调控功能基因表达的重要候选标记 -
功能标记
涵包含部分玉米油分、抗旱和抗病的功能标记 -
均匀覆盖
全基因组均匀覆盖，基因密度高的区段加设标记
Result display
结果展示
提高玉米种子在低温下的出苗能力是一个非常重要的育种目标。该研究利用4 个低温发芽能力不同的亲本构建了3 个F2:3 群体， 通过玉米6K 芯片获得基因分型，利用2,693 个SNP 标记构建一致性遗传连锁图谱，在10℃鉴定5 个低温出苗能力相关表型，QTL 定 位结果获得43 个QTL 和３个Meta-QTL（mQTL），这些结果为在mQTL 区域内克隆基因及发现玉米种子萌发过程的耐寒性分子机 制提供了基础。
图1 三个群体的低温发芽相关性状检测到的QTL
表1 通过一致性连锁图谱检测到的Meta-QTL (mQTL)
参考文献：Li X, Wang G, Fu J, et al . QTL Mapping in Three Connected Populations Reveals a Set of Consensus Genomic Regions for Low Temperature Germination Ability in Zea mays L. Front. Plant Sci . 2018.
Application scenario
芯片应用场景
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保种育种应用 /Conservation breeding applications
分子标记辅助育种品种鉴定亲缘关系鉴定 -
基础科研 /Basic research
QTL定位重要标记筛选