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植物全基因组分型芯片 ——高通量、精准、性价比高                

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP) 是指基因组单个核苷酸的变异,其数量众多、分布密集、易于检测,使得利用SNP分型芯片来进行品种的改良已经成为现代农业研究的一个常用方法。通过植物SNP 分型芯片,检测位点由传统的几十对基因提高到现在的几千甚至几万个位点,检测的准确度和通量也随之成倍地增加。

Plant genome SNP genotyping array

植物全基因组SNP分型芯片

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Technological process

技术流程

Sample requirements

样本要求

  •                            

    DNA样品

     总量:

    ≥ 1.0μg

     浓度:

    ≥ 50ng/μL

  •                            

    组织样本

     总量:

    ≥ 200mg

  •                            

    细胞样本

     总量:

    ≥ 1X107

Bioinformatics Analysis

生信分析

  • 基本分析 /Basic analysis                            
                               
    芯片质控分析
    样本质控分析
    SNP分型结果
    SNP Plink格式的分型结果
  • 高级分析 /Advanced analysis                            
                               
    选择信号分析
    时间序列分析
    亲缘关系鉴定
    进化分析
    品种鉴定
    Haploview分析
    CNV分析
    全基因组关联分析
  • 个性化分析 /Personalized analysis                            
                               
    两个样本之间SNP分型差异位点统计
    两个样本之间相同SNP分型位点统计
    比较组间交集SNP