“中芯一号”——GS研究利器,精选好种育好猪!
育种的核心是育种目标和选育群体,如果没有合适的育种方法,是无法进行新品系的培育和新配套系的研发等工作的。因此,足够了解核心育种群体的情况,依照育种目标对群体进行优化和调整是十分重要的工作。根据核心群体的状况,利用分子技术进行GS选育,通过表型和基因型数据分析,可以帮助猪场的育种部门更好的了解和管理自己的群体。
什么是GS
GS(全基因组选择研究)通过检测覆盖猪全基因组的分子标记,利用基因组水平的遗传信息对个体猪进行遗传评估,可以获得更高的育种值估计准确性。对早期难以度量的性状进行选择,缩短世代间隔,加速育种进程,从而节约大量的育种成本。估算个体基因组育种值,对育种场选育群体进行打分排名,实现早期精准选育。
GS选择一般需要三个步骤:
①收集表型和个体的SNP芯片基因型,构建参考群体;
②利用参考群体,估计SNP标记的效应值;
③利用SNP效应值,估计候选群体的基因组育种值。
使用GS预期的效果
1、缩短世代间隔,实现待选群体的早期选留;
2、提高育种值估计准确性;
3、降低育种成本,减少性能测定的数量;
4、加速遗传进展,实现20%或更多的遗传进展。
“中芯一号”——GS研究利器
“中芯一号”作为一款SNP芯片,富集了猪的抗K88仔猪腹泻因果位点、酸肉改良因果位点、健康脂肪酸因果位点、改良肉色紧密位点等422个性状相关位点,涵盖猪从出生到屠宰共10个时间点,拥有51,368个SNP位点,其中包含有81个亚洲特有地方品种位点,对家猪基因组育种研究和应用,具有高效性和精准性优势,对我国特有猪品种的选育工作更具针对性。
“中芯一号”优点多多
一、全面性:
1、评估性状全面:涵盖猪从出生到屠宰整个生育期的繁殖、生长肥育、胴体、肉质、免疫等七大类、422个性状。
2、评估群体全面:杜长大、F2资源家系、两头乌、苏太、嵌合家系、莱芜、二花脸、巴马香、疝气等9个群体作为参考群。
3、单倍型库全面:目前已有涵盖杜、长、大主要商品品种及中国六大类型地方品种高覆盖度的基因组全序列单倍型库。
二、先进性:
1、按功能区分标记类型:因果突变、紧密关联、一般关联、基因组分布位点。
2、包含控制重组率基因:可通过重组增大表型变异,增进遗传进展。
3、等位基因效应已知:部分功能检测不需要构建参考群,新测表型可纳入现有参考群中更新效应。
4、芯片可升级:可依据增测的表型数据和填充后的基因组全序列不断增加因果位点和紧密关联位点数目,升级芯片。
5、重组冷热点:考虑重组冷热点,设计芯片分布密度。
“中芯一号”是猪育种行业内专家们群策群力,集成几十年的科学研究成果,自主设计的育种芯片,将有效推进我国种业自主创新进程,为打造“华系种猪”品牌提供技术保障。
“中芯一号”现已上市,
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