水稻可应用分子标记数量较多，应用分子标记辅助育种，能提高育种效率、降低育种成本，加速新品种精准高效选育。康普森拥有 KASP、MassARRAY 质谱和 CAGT® 靶向捕获测序平台，育种家可以根据自己的材料在康普森水稻功能基因数据库中定制开发更“适合的”分子标记，提高分子育种的效率和准确性，也可以利用GWAS、QTL、BSA定位定制化开发关注性状的功能标记。
| 性状分类 | 基因/位点 |
| 产量 | GS3 |
| GS5 | |
| GW2 | |
| GL3.1 | |
| 0sLG3b | |
| OsLG3 | |
| GW7 | |
| OSSPL13 | |
| GSE5 | |
| FZP | |
| OSSPL14 | |
| 稻瘟病 | pigm |
| pita | |
| Pi21 | |
| Pish | |
| Pid3 | |
| 抗旱 | OsbHLH120 |
| DRO1 | |
| OSJAZ1 | |
| 耐冷 | CTB4a |
| 品质 | Wx |
| ALK | |
| Chalk5 | |
| badh2/fgr | |
| GW7 | |
| GBSS1 | |
| 倒伏 | sd1 |
| Gn1a | |
| 理想株型 | OSOTUB1(NPT1) |
| qWS8 |
材料易备，方法简单。
快速定位，结果准确可靠。
可根据需求进行定制开发。
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